BLAST është një algoritëm kompjuterik që është i disponueshëm për përdorim në internet në faqen e internetit të Qendrës Kombëtare për Informacionin Bioteknologjik (NCBI), si dhe në shumë sajte të tjera. BLAST mund të rreshtojë dhe krahasojë me shpejtësi një sekuencë të ADN-së me një bazë të dhënash sekuencash, gjë që e bën atë një mjet kritik në kërkimin e vazhdueshëm gjenomik.
A është BLAST një bazë të dhënash parësore?
BLAST është softueri më i përdorur në kërkimin e bioinformatikës. Funksioni i tij kryesor është të krahasojë një sekuencë me interes, sekuencën e pyetjeve, me sekuencat në një bazë të dhënash të madheBLAST më pas raporton ndeshjet më të mira, ose “hits” që gjenden në bazën e të dhënave. Ky program i thjeshtë ka dy aplikacione kryesore.
A është NCBI një bazë të dhënash?
NCBI strehon një seri bazash të dhënash të rëndësishme për bioteknologjinë dhe biomjekësinë dhe është një burim i rëndësishëm për mjetet dhe shërbimet e bioinformatikës. Bazat kryesore të të dhënave përfshijnë GenBank për sekuencat e ADN-së dhe PubMed, një bazë të dhënash bibliografike për literaturën biomjekësore. Bazat e tjera të të dhënave përfshijnë bazën e të dhënave NCBI Epigenomics.
A përdoret BLAST vetëm në bazat e të dhënave NCBI?
BLAST është i disponueshëm në ueb në faqen e internetit të NCBI. Lloje të ndryshme BLAST janë të disponueshme sipas sekuencave të pyetjeve dhe bazave të të dhënave të synuara.
Si funksionon baza e të dhënave BLAST?
Si funksionon BLAST? BLAST identifikon sekuenca homologe duke përdorur një metodë heuristike e cila fillimisht gjen përputhje të shkurtra midis dy sekuencave; Kështu, metoda nuk merr parasysh të gjithë hapësirën e sekuencës. Pas ndeshjes fillestare, BLAST përpiqet të fillojë rreshtimet lokale nga këto ndeshje fillestare.
