1.1 α-Helices. A-spiralja është një element i zakonshëm i strukturës dytësore të proteinave, i formuar kur aminoacidet "përfundojnë" për të formuar një spirale të djathtë ku zinxhirët anësor dalin nga spiralja qendrore (Fig. 3.1A, B).
Çfarë e shkakton formimin e helikave alfa?
Heliksi alfa karakterizohet nga një kthesë e ngushtë djathtas në zinxhirin e aminoacideve që e bën atë të formojë një formë shufre. Lidhjet e hidrogjenit ndërmjet hidrogjenit në një grup amino dhe oksigjenit në një grup karboksil në aminoacidin shkaktojnë këtë strukturë.
Si formohen spirale alfa dhe fletët beta?
Heliksi alfa formohet kur zinxhirët polipeptid përdredhin në një spirale Kjo lejon që të gjitha aminoacidet në zinxhir të formojnë lidhje hidrogjeni me njëri-tjetrin.… Fleta e palosur beta është zinxhirë polipeptidikë që kalojnë përgjatë njëri-tjetrit. Quhet fleta e palosur për shkak të pamjes së valëzuar.
Cilat aminoacide formojnë spirale?
Sekuenca të ndryshme aminoacide kanë prirje të ndryshme për të formuar strukturë α-spiral. Metionina, alanina, leucina, glutamati dhe lizina të pakarikuara ("MALEK" në kodet me 1 shkronja të aminoacideve) të gjitha kanë prirje veçanërisht të larta për formimin e spirales, ndërsa prolina dhe glicina janë të dobëta prirjet për formimin e spirales.
Si formohet struktura sekondare e proteinave nga struktura parësore?
Struktura primare e një proteine përcaktohet vetëm nga sekuenca e saj aminoacide dhe është e ndërtuar nga lidhjet peptide midis mbetjeve të aminoacideve ngjitur. Struktura dytësore rezulton nga lidhja e hidrogjenit përgjatë shtyllës kurrizore të polipeptidit, duke rezultuar në alfa-spira dhe fletë beta-palosje.
