Metagjenomika përkufizohet si analiza e drejtpërdrejtë gjenetike e gjenomave të përmbajtura me një kampion mjedisor Fusha fillimisht filloi me klonimin e ADN-së mjedisore, e ndjekur nga shqyrtimi i shprehjes funksionale [1], dhe më pas u plotësua shpejt nga renditja e drejtpërdrejtë e rastësishme me armë gjahu të ADN-së mjedisore [2, 3].
Cili është procesi i metagjenomisë?
Metagjenomika përfshin marrjen e ADN-së nga të gjithë mikroorganizmat brenda një komuniteti, pa identifikuar domosdoshmërisht të gjitha speciet e përfshira. Pasi gjenet të renditen dhe krahasohen me sekuencat e identifikuara, funksionet e këtyre gjeneve mund të përcaktohen.
Cila teknikë përdoret në metagjenomikë?
Një kampion i komunitetit mikrobik është mbledhur nga uji i detit, sedimenti, kafsha pritëse ose habitate të tjera detare. Qelizat e grumbulluara më pas lizohen dhe ADN-ja nxirret nga lizati i tyre. Teknika që e bën të mundur metagjenomikën është sekuenca e pushkës së gjahut, e cila rendit rajone të rastësishme të ADN-së në një mënyrë të pacaktuar.
Cilat janë 3 hapat për studimin e metagjenomisë?
Hapat dhe procesi i metagjenomisë:
- Mbledhja e mostrës:
- Nxjerrja e ADN-së:
- Përgatitja e mostrës:
- Analiza e mostrës:
Si kryhet metagjenomia funksionale?
Metagjenomika funksionale përfshin izolimin e ADN-së nga komunitetet mikrobike për të studiuar funksionet e proteinave të koduara. Ai përfshin klonimin e fragmenteve të ADN-së, shprehjen e gjeneve në një bujtës zëvendësues dhe ekzaminimin për aktivitetet enzimatike.
